有机肥原料多为畜禽粪便、秸秆等农林废弃物，原生物料携带大量虫卵、致病菌，未经发酵直接施用会在土壤内部二次分解放热，极易灼伤作物根系造成烧苗烂根；通过好氧高温发酵，可维持 55℃以上高温杀灭有害病虫实现无害化达标，同时依靠微生物将粗纤维、大分子有机质分解为腐殖酸、氨基酸等作物易吸收的小分子养分，留存氮磷钾养分避免氨气挥发流失，彻底消解粪污恶臭满足环保生产要求；腐熟后的物料质地稳定，既可以长效改良土壤、破除板结、缓解连作障碍，也满足国家有机肥生产国标要求，可顺利加工粉状、颗粒肥料，是有机肥具备使用价值、合规生产流通必不可少的核心工序。

主流发酵方式为条垛 / 槽式 / 罐式发酵